De collectie van Mu.ZEE geeft een overzicht van de Belgische beeldende kunst van 1830 tot op vandaag. Kunstenaars als James Ensor, Léon Spilliaert en Constant Permeke zijn goed vertegenwoordigd. Daarnaast zijn er belangrijke deelcollecties van interbellumkunstenaars, ensembles van kunstenaars werkzaam na Wereldoorlog II en vanaf de jaren 1980 en 1990. Dankzij een actief aankoop- en schenkingsbeleid verwerft Mu.ZEE bovendien kunstwerken van hedendaagse kunstenaars.
Dit zijn de aankopen voor 2022:
Daarnaast werden een aantal langdurige bruiklenen van de Collectie Vlaamse Gemeenschap toegewezen aan Mu.ZEE:
Ontdek de Mu.ZEE-collectie op de website van het museum.